? Obično svaka molekula DNK unutar vaših stanica sadrži dva lanca združi interakcijama nazivaju vodikove veze . Promjena u uvjetima , međutim , može ” denaturirati ” DNA i uzrokuje ove niti razdvojiti . Dodavanja jake baze , kao što je NaOH , dramatično povećava pH , čime smanjuje koncentraciju vodikovih iona u otopini i denaturirajućim dvolančanu DNA . Utjecaj pH
ionska koncentracija hidroksid i pH imaju izravnu povezanost , što značivišu pH , što je veća koncentracija hidroksid . Slično ,niža koncentracija vodikov ion pada . Pri visokom pH , a zatim je otopina bogata hidroksidnih iona , i ti negativno nabijene ione može povući vodikovih iona izvan molekula poput parova baza u DNA . Ovaj proces narušava vodikove veze koja drži dva lanca DNK zajedno , nanoseći im da se odvoje.
RNK vs DNK
razliku od RNA , DNA nedostaje hidroksilne skupine na 2 ‘ pozicija u svakoj skupini šećera . Ova razlika čini DNK mnogo stabilniji u lužnatom otopinom . U RNA ,hidroksilna skupina na položaju 2 ‘ može odustati vodikov ion u otopini pri visokom pH , stvaranje vrlo reaktivnu alkoksidne ion koji napada fosfatne skupine drži zajedno dvije susjedne nukleotida . DNK ne pate od tog defekta i tako uživa izuzetnu stabilnost pri visokim pH .
Alkalna za ližu
Molekularni biolozi često koriste alkalne denaturizacija izolirati plazmida DNA iz bakterije . Plazmidi su malo petlje DNA odvajaju od bakterijskog kromosoma . U alkalnom lizu Miniprep , biolozi dodati deterdžent i natrijev hidroksid da bakterije resuspendirane u otopini . Deterdžent otapa bakterijske stanične membrane , doknatrijev hidroksid povećava pH i činijako alkalna otopina . Kao što je slomljena stanice otpuštaju svoj sadržaj ,DNA unutar razdvaja na svoje sastavne pramenove , ili denatures .
Reannealing
Nakonbiolog izdvaja DNK iz stanica , on dodaje drugi reagens za vraćanje otopine više neutralnog pH i istaloži deterdžent . Promjena pH omogućuje plazmida niti da reanneal ; prostran kromosoma , međutim , ne može učiniti isto , pabiolog može ukloniti ga zajedno s deterdžentom , denaturirani proteini i druge ponekog smeća , ostavljajući iza sebe plazmida . Alkalna lize ne u potpunosti očiste plazmida DNA ; umjesto toga, on služi kao” brz i prljavo ” način da ga izvući iz ćelije i ukloniti većinu drugih onečišćivača .